MV的女主角是迈克尔·杰克逊的第一任妻子，猫王的女儿丽莎·玛丽·普雷斯利（Lisa marie Presley）。R.Kelly在失去了他生活中亲近的人后写了这首歌，反映他个人生活中的困难时期。他后来把样带给迈克尔·杰克逊，迈克尔非常喜欢这首歌，并决定与R.Kelly一起制作它。迈克尔·杰克逊对这首歌的兴趣也与当时他个人生活中最近发生的事有关。对于能与偶像一起工作，Kelly极其激动兴奋。在给迈克尔的那盘带中，Kelly模仿迈克尔·杰克逊的唱腔来唱《You Are Not Alone》。他说：“我想象我就是他。我成为了他。我想让他也有这种感觉。”迈克尔·杰克逊听后觉得这个解释很有趣。